Сергей, вот у меня прям также было. Абсолютно рабочие часы правильно подключенные и не работают. Помогла замена часов (100 раз пробовал батарейки из них вытаскивать, подключать/отключать, перезагружать итд.) и после замены заработали, а потом старые тоже заработали на другом контроллере... Тут будет интересно что kapelan думает по этому поводу.
Друг который разбирается хорошо в ардуино так и не смог сказать почему так, предположил что в прошивке дело.
На всякий случай напишу как у меня подключено.
БП 12V, к нему подключено:
1) параллельно электролитический конденсатор
2) дозирующая помпа (к ней параллельно еще один электролитический конденсатор, керамический конденсатор и последовательно выпрямительный диод)
3) релейный модуль (Vin и земля)
4) DC-DC преобразователь (его выставил на 7 вольт).
К DC-DC преобразователю подключил ардуину к Vin и земле.
Ардуина их преобразовывает до 5V (VCC) и вот к ним уже подключены часы и датчик температуры.
Драйверы светодиодов питаются от отдельного БП от старого ноутбука 19V.