Достаточно краном регулировать, если тонкой настройки вообще шикарно.
И никаких танцев с бубнами и муфт не надо выдумывать.
Единственно посоветую сделать трубы слива и перелива съемными, т.е. на конце трубы муфта которая надевается на патрубок-переходную муфту в дне.Тогда удобно обслуживать шахту,а чистить дентрит в ней желательно хотя бы раз в полгодика, ну если конечно вам не нравится ил в 1-2см. толщиной в шахте.
Думаю вы забываете ДЛЯ ЧКГО вообще волна(вейвбокс) нужен в банке,Волна нужна не для вымывания грязи из камней и не для чистого дна,и не нужна более 2 сантимов высотой(для банок до 1500см.)Нужна просто амплетуда туда-обратно, даже если она будет минимала это уже большой плюс.
Волна нужна для лучшего, комфортного принятия пищи кораллам, т.е. когда летит пылинка в потоке то она просто огибает препятствие(коралл) и пролетает мимо, простая аэродинамика,,а с волной происходит амплетуда туда-обратно и у коралла больше шансов поймать еду.
И по этому не важна длинна банки, хоть 50см.главноее создать поступательные колебания.