Почему в системе, где есть крипт, т.е. рыбы являются его носителями, при хороших условиях не происходят то и дело вспышки эпидемии?
Я уже писал. Это нелинейная динамическая система.
Также часть ответов тут: https://reefcentral....639#entry557639
Почему часто при сбое в таких условиях эпидемия возникает?
А часто не возникает. ) И что? )
Вы упорно продолжаете оперировать разными мыльными терминами типа "условия", "хорошая вода" и т.д. и не даёте никакой конкретики, приводя отмазки, разный иммунитет, ОРВи, ГРИПП и около. Даже с огромными допущениями и погрешностями. Потому что сами прекрасно понимаете, что как только вы попытаетесь дать цифры - вас тут же можно будет начать методично тыкать носом в конкретные примеры где ваша гипотеза лажает.
И самое главное - почему при эпидемии не все рыбы болеют?
Обычно это зависит от вида рыбы и типа её покрова. Кожистые типа белогрудых-хепатусов обычно заболевают сразу. С мощной чешуёй - не сразу, а некоторых так вообще не берёт. Также могут сказываться и многие другие факторы, например - как рыба спит, закапывается ли, стоит в углу аквариума или же постоянно по всей банке плавает и т.д. и т.д. и т.д. и т.д. Масса факторов, влияющих на вероятность встречи рыбы и паразита и его проникновения. Математика + механика. Никакой биологии и иммунитетов. 
Можно долго продолжать.
Но пока известен только этот механизм, он подробно описан и эти подробности хорошо объясняют разные ситуации с заболеванием и сопротивлением ему.
Он не известен применительно к крипту. Также как его не существует применительно к людям и клопам. Это вы его за уши пытаетесь притянуть.
зачем это море 
